美國食品藥物管理局(US Food and Drug Administration; FDA)緊急授權加州Cepheid公司銷售一種快速篩檢導致新型冠狀肺炎(Covid-19)病毒SARS-CoV-2的新方法。Cepheid由Kurt Petersen、Allen Northrup和其他五個人于1996年創立,由于商業化基于微流體芯片的聚合酶鏈反應(PCR)分析設備,而在MEMS領域頗負盛名。但這并不是Cepheid第一次迅速響應這一類細菌或病毒等生物威脅。電池電路板小編還了解到,在2001年美國發生炭疽熱(anthrax)恐怖攻擊之后,Cepheid率先為美國郵政(U.S. Postal Service)提供了炭疽桿菌快篩能力,至今仍在使用中。
當今所有Covid-19檢測方案的核心都是實時反轉錄聚合酶鏈反應(RT-PCR)分析技術。簡單來說,實時RT-PCR利用熱循環擴增患者拭抹樣本中的DNA,然后透過熒光光學檢測來搜尋病毒的特定基因組。
這項測試首先需要了解病毒的基因組;中國科學家于2020年1月10日首次公開發表了SARS-CoV-全基因組測序的關鍵工作。在確定了該病毒的基因組后,以德國為主導的一支研究小組僅花了7天時間就發表了用于測試患者樣本的第一項方案,目前已由世界衛生組織(World Health OrganizaTIon;WHO)加以采用。現在還有其他可能更快速也更經濟的病毒檢測方法也在研究中,例如抗體檢測或CRISPR-Cas13測試等。
傳統的PCR設備需要數小時才能完成熱循環并取得結果。此外,由于患者拭抹樣本中潛在的病毒量較低以及擴增DNA的固有限制,傳統的PCR方法可能會導致大量假陰性反應。為了對抗傳染性疾病爆發,必須既快速又準確地在患者等待的幾分鐘內完成篩檢,以防止陽性患者被漏檢,而對于其他人造成不必要的風險。
MEMS技術為PCR帶來了兩項重要優點:縮減尺寸以及整合微流體。MEMS加熱器和反應室的熱質量很小,因此可顯著加快熱-冷循環,并在數分鐘內迅速得到結果。電路板廠發現,這種用于樣本和試劑處理的微流體整合實現了大規模應用的新技術,例如數字PCR (dPCR)。
數字PCR方法利用微流體信道將患者的樣本分成多個微孔數組或微滴乳狀液(稱為液滴數字PCR或ddPCR)等多個單獨的樣本。然后再將這些微量樣本進行平行PCR處理,使其聚合后產生樣本中目標分子總數。這種樣本的微觀平行處理顯著提高了檢測下限,從而提高了測試結果的準確性。
用于數字PCR的微流控室數組(來源:CombinaTI)
近來在湖北自然科學基金會(Hubei Natural Science FoundaTIon)贊助的一項研究()中,證實了采用基于MEMS和微流體的PCR工具與技術來檢測SARS-CoV-2,比傳統的PCR方法更具優勢。在這項研究中,液滴數字PCR (ddPCR)和傳統PCR一并用于測試患者樣本。這項發表于今年3月6日的初步研究結果(尚待進一步的臨床試驗證實)顯示,ddPCR的SARS-CoV-2檢測閾值比傳統PCR閾值低500倍。這一結果意味著,在患者樣本中病毒載量可能較低的情況下,ddPCR比傳統PCR更有可能準確篩檢出陽性患者。
MEMS PCR芯片的開發始于1990年代初。美國勞倫斯利佛摩國家實驗室(Lawrence Livermore NaTIonal Laboratory;LLNL)由Allen Northrup領軍的研究小組于1993年發表了第一個基于硅的PCR芯片相關論文,該芯片后來也在1996年授權給Cepheid。過去幾十年來,有關如何使用MEMS材料和方法制造新穎PCR芯片,以及由硅、玻璃甚至塑料基材制成微型整體分析系統(uTAS)的研究一直在持續進行中。